La personnalisation des fichiers de configuration doit être faite de préférence dans les fichiers templates eux-même en créant votre module personnalisé. Ainsi lorsqu'un nouveau build sera lancé, vos modifications ne seront pas écrasées.
Dans chaque fichier de config, vous trouverez des références aux variables d'environnements du type :
<?php echo getenv('APPNAME_HOME'); ?>
Ceci fait référence à la variable XXX_HOME qui vous a été demandé lors du premier build. Il est important de conserver le préfixe APPNAME_ car il sera remplacé automatiquement pas le vrai nom de votre application au moment du build. Procéder ainsi vous permet de déployer rapidement et facilement votre application sans vous soucier des chemins et du nom de votre application, vous pouvez changer de répertoire votre application entière par simple édition des variables d'environnement contenues dans le fichier pkgi.env